Melgar de Abajo corresponde a la antigua población romana de Camala. Fue poblada en el año 998 por el Conde de Hernán Mentales, en cuya época recibió también fuero. El caballero Fernán Armentales fue fundador de varias poblaciones en la Ribera del río Cea, entre otras Melgar de Abajo y Melgar de Arriba.

(El Conde Garci Fernández, hijo de Fernán Gonzáles, concedió grandes exenciones y libertades a aquellos pueblos, confirmados luego por D. García, quien se intitulaba Obispo de Burgos).

Consta que Doña Aldonza, viuda de D. Pedro Ponz, dio en el año 1254, al monasterio de Sahagún su Villa de Melgar de Abajo, con sus vasallos, haciendas, molinos, etc., y disponía que su enterramiento tuviese lugar en aquella casa religiosa. El monasterio la recibió por hermana, entregando ella en encomienda por su vida, cuanto tenía en Santervás, Valparaíso, Manzubes, Fontihoyuelo, etc.

En el siglo XV era Melgar de Abajo cabeza de Condado, "Hace por armas las de sus dueños, en mantel dos castillos de oro campo rojo, y abajo un león de púrpura coronado sobre plata".

San Juan Evangelista y El Salvador son las iglesias parroquiales. Ambas de estilo barroco, pero parece ser que la de San Juan, fue construida sobre otro edificio, del cual puede observarse alguna influencia mozárabe.

En las décadas de los años 60 y 70 Melgar empezó su lento despoblamiento, ya que la juventud inició la migración hacía las ciudades, las costas españolas, en su mayoría, en busca de trabajo.

En la actualidad hay un grupo de jóvenes interesados en actualizar el campo, la ganadería y fábricas relacionadas con la alimentación y el vino. También es un lugar magnífico para pasar el verano, ya que tiene el río Cea con su gran arboleda, buenas comunicaciones por carretera y sus gentes muy hospitalarias. La gastronomía típica es : El lechazo en todas sus variantes y el bacalao al ajo arriero y en su repostería destacan los sequillos y los migueles.